0 просмотров
Рейтинг статьи
1 звезда2 звезды3 звезды4 звезды5 звезд
Загрузка...

Сдать анализ на norovirus ii рнк реал тайм пцр

Норовирус, РНК Norovirus 1 и 2 типов

Описание

Норовирус, РНК Norovirus 1 и 2 типов, качественный — определение РНК Norovirus в кале, методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с детекцией в режиме «реального времени».

Метод ПЦР — позволяет идентифицировать в биологическом материале искомый участок генетического материала и обнаружить единичные молекулы ДНК вируса, не выявляемые другими методами. Принцип метода основан на многократном увеличении числа копий, специфичных для данного возбудителя участка ДНК.

С помощью ПЦР-анализа можно диагностировать инфекцию в остром периоде и выявлять случаи носительства.

Норовирус (Norovirus) — это содержащий РНК вирус семейства Caliviridae. Желудочно-кишечную инфекцию, вызванную норовирусом, в народе называют «желудочный грипп».

Норовирус — это важнейший возбудитель вспышек небактериальной диареи во всех возрастных группах пациентов.

Различают несколько геногрупп норовируса — G1, G2, G3, G4, G5, которые далее подразделяются на разные генотипы. Геногруппа, поражающая человека — это 1, 2 тип. Наиболее распространенной является 2-ая геногруппа (G2), на долю которой приходится до 80–90% всех случаев норовирусного гастроэнтерита.

Норовирусная инфекция
Норовирусная инфекция поражает все возрастные группы, но чаще детей школьного возраста и взрослых. Восприимчивость к норовирусам повсеместная. Сведения о появлении иммунитета после заболевания неопределенные. Резистентность к определённому штамму вируса может продолжаться от 4–6 месяцев до 2–3-х лет.

Основной путь передачи — фекально-оральный, то есть посредством зараженной пищи и контактный.

Источники инфекции: больной человек.

Длительность инкубационныого периода от 24 часов до 3 дней.

Клинические проявления норорирусной инфекции
Клинические проявления заболевания, вызванного норовирусами: тошнота, рвота, диарея, острые приступы боли в области кишечника (вплоть до судорог), иногда развивается потеря вкуса, кишечные колики, озноб, головная боль, общее недомогание. Также часто наблюдаются сонливость и апатия, боль и «ломота» в мышцах, повышение температуры тела до 38–38,5, отсутствие аппетита. Лихорадка присутствует в половине случаев, как правило невысокая. Диарея умеренная по количеству 4–8 раз в сутки, без примеси крови. Неприятные симптомы проходят через 3–4 дня. Более тяжелое течение отмечается у ослабленных и у больных со сниженным иммунитетом.

ПЦР позволяет найти в исследуемом клиническом материале небольшой участок генетической информации (ДНК) любого организма среди огромного количества других участков и многократно размножить его.

Показания:

  • острая кишечная инфекция с превалированием симптомов острого гастрита и гастроэнтерита (по клиническим показаниям), а также при наличии очага групповой заболеваемости или внутрибольничной инфекции;
  • обследование контактных лиц или лиц из состава декретированных групп по эпидемическим показаниям.

Подготовка
Для получения достоверного результата, анализ должен проводиться спустя 14–21 день после последнего приема антибактериальных препаратов.

Кал собирается в одноразовый контейнер с завинчивающейся крышкой в объеме не более 1/3 от объема контейнера. Кал должен быть свежесобранным. Материал доставляется в медицинский офис в течение 4–6 часов с момента сбора анализа.

В направительном бланке обязательно должен быть указан диагноз и дата начала заболевания, сведения о приёме антибиотиков. При взятии материала необходимо соблюдать стерильность.

Условия, соблюдение которых обязательно:

  • не допускается замораживание;
  • не допускается длительное хранение (более 5–6 часов);
  • не пригодны никакие транспортные среды, кроме указанной;
  • не допускается неплотно закрытый контейнер;
  • не подлежит исследованию биоматериал, собранный накануне.

Интерпретация результатов
Аналитическая чувствительность (фекалии) — 5х103 ГЭ/мл.

Форма представления результата: тест качественный. Результат выдается в терминах «обнаружено» или «не обнаружено».

«Обнаружено»:

  • норовирусная инфекция на фоне клинических проявлений и до полутора месяцев после исчезновения симптомов (возможен более длительный период на фоне иммуносупрессии);
  • положительный результат не исключает других (вирусных или бактериальных) причин гастроэнтерита.

«Не обнаружено»:

  • отсутствие РНК норовирусов 1,2-ой геногруппы в исследуемом материале;
  • концентрация РНК норовирусов 1,2-ой геногруппы в исследуемом материале ниже предела детекции.

Norovirus II, РНК [реал-тайм ПЦР]

Выявление возбудителя норовирусной инфекции (Norovirus II генотипа), в ходе которого с помощью метода полимеразной цепной реакции в реальном времени (реал-тайм ПЦР) определяется генетический материал (РНК) норовирусов в образце кала.

Синонимы русские

Норовирус II генотип, норовирусная инфекция [полимеразная цепная реакция в режиме реального времени].

Синонимы английские

Norovirus G II, RNA [polymerase chain reaction, real-time PCR].

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Как правильно подготовиться к исследованию?

  • Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить (по согласованию с врачом) прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.), и препаратов, влияющих на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Общая информация об исследовании

Норовирус (Norovirus) – это РНК-содержащий вирус, относящийся к семейству Caliciviridae и приводящий к возникновению желудочно-кишечной инфекции в форме острого гастроэнтерита. Норовирусы классифицируются на шесть геногрупп: GI – GVI. В соответствии со сложившейся номенклатурой, известно около 38 генотипов данных вирусов. Для человека наиболее патогенными являются норовирусы GI, GII, GIV. По современным литературным данным, самой распространенной геногруппой в инфицировании человека является геногруппа GII. Она содержит до 19 генотипов и генотипы GII.3, GII.6, GII.12 ассоциированы с передачей инфекции через продукты питания.

Читать еще:  Сдать анализ на аллерген e1 эпителий кошки igg

Известно несколько путей передачи норовирусной инфекции: фекально-оральный, воздушно-капельный и контактно-бытовой. К факторам передачи данной инфекции относятся загрязненная пища, вода, источником инфекции является больной человек. Широкому распространению инфекции способствует высокая устойчивость вирусов к дезинфектантам, высокая жизнеспособность и малая заражающая доза возбудителей.

Норовирусная инфекция является высококонтагиозным заболеванием и может протекать в виде единичных случаев, групповых случаев и вспышек. Данный возбудитель является причиной возникновения более 90 % небактериальной природы и около 50 % всех случаев гастроэнтеритов. К инфекции восприимчивы люди всех возрастных групп, но чаще описываются случаи заболевания у детей школьного возраста и взрослых.

Инкубационный период развития инфекции составляет от 10 до 51 часа, в среднем 24-48 часов. Начало заболевания острое, многие пациенты отмечают озноб без лихорадки. Следует отметить, что повышение температуры появляется лишь в половине случаев заболевания и характеризуется в основном субфебрилитетом. К основным клиническим проявлениям заболевания относятся тошнота и рвота, сопровождающиеся слабостью, головокружением и головной болью. Многие больные жалуются на боли в мышцах. Боли в животе отмечаются не во всех случаях заболевания, они могут носит ноющий или схваткообразный характер с локализацией в верхней половине живота. Диарея развивается менее чем у половины заболевших.

Современным методом диагностики норовирусной инфекции является метод полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Это метод молекулярной диагностики, позволяющий на ранних этапах заболевания выявлять фрагменты генетического материала (РНК) вируса. Он характеризуется высокой чувствительностью и специфичностью, а также позволяет получить результат в более короткие сроки по сравнению с большинством других анализов, что делает ее незаменимым инструментом для своевременной диагностики вирусной инфекции, позволяет в режиме реального времени со стопроцентной точностью определить возбудителя кишечной инфекции. Своевременная диагностика помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.

Для чего используется исследование?

  • Для выявления больных с норовирусной инфекцией II генотипа.
  • Для установления этиологического фактора острой кишечной инфекции.
  • Для дифференциальной диагностики причин острого гастроэнтерита.

Когда назначается исследование?

  • При симптомах острого гастроэнтерита, вероятно, инфекционной этиологии (тошнота, рвота, лихорадка, боли в животе, диарея).
  • При одновременном или последовательном развитии симптомов острой желудочно-кишечной инфекции у нескольких членов семьи, у детей в детском учреждении, в рабочем коллективе или пациентов в стационаре.
  • При дифференциальной диагностике заболеваний, протекающих со сходными симптомами: бактериальные диареи, пищевые токсикоинфекции, другие вирусные диареи.

Что означают результаты?

Референсные значения: отрицательно.

  • наличие норовирусной инфекции, вызванной норовирусом (Norovirus) II генотипа.
  • отсутствие Nororvirus II генотипа в исследуемом биоматериале.



Важные замечания

  • Рекомендуется проводить исследование в первые 2-3 суток от начала заболевания, а у госпитализированных пациентов – в первый день госпитализации.

Также рекомендуется

[09-134] Острые кишечные инфекции, скрининг (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus)

[09-075] Enterovirus, РНК [ПЦР]

Кто назначает исследование?

Терапевт, педиатр, инфекционист, гастроэнтеролог, врач общей практики

Ротавирус гр. А, норовирус 2 геногруппы, астровирус, РНК (Rotavirus A, Norovirus 2, Astrovirus, ПЦР) кал, кач.

Информация об исследовании

Ротавирусы группы А (Rotavirus A)
Ротавирусное заболевание (ротавирусный гастроэнтерит) — острая вирусная инфекция с преимущественным заболеванием детей, характеризующееся симптомами острой интоксикации, поражением желудочно-кишечного тракта и дегидротацией.
Ротавирусы (Rotavirus) — род вирусов из семейства Reoviridae.
В соответствии с антигенной специфичностью выделяют 3 группы ротавирусов: А, В, С. Ротавирусы группы А вызывают большинство случаев ротавирусной инфекции.
Эпидемиология.
Источник и резервуар инфекции: только человек. Возбудитель выделяется с испражнениями (в 1г. кала содержится от 10 до 100 вирусных частиц) на протяжении до 3-х недель (чаще 7-8 дней от начала болезни).
Путь передачи: фекально-оральный.
Как в развивающихся так и в развитых странах ротавирусы самый частый возбудитель тяжелой диареи с обезвоживанием у детей до 3-х лет. Они вызывают 30-50% гастроэнтеритов, требующих госпитализации и интенсивной регидротации.Тяжёлые ротавирусные инфекции наблюдаются в основном в первые годы жизни, но ротавирусы часто обнаруживают при диареи и у взрослых (чаще контактирующих с заболевшими грудными детьми) и у пожилых лиц с иммунодефицитом. Ротавирусы также вызывают 10% случаев диареи путешественников.
Клиническая картина.
Ротавирусы вызывают гибель зрелых клеток тонкого кишечника, они замещаются незрелыми всасывающими клетками, неспособными адекватно абсорбировать углеводы и другие питательные вещества, что приводит к осмотической диарее.
Инкубационный период длиться 1-5 суток.
Острый период длиться 3-7 суток(при тяжелом течении болезни более 7 суток).
Период реконвалесценции 4-5 суток.
Для ротавирусной инфекции характерно острое начало: рвота, резкое повышение температуры тела, понос, зачастую и очень «узнаваемый стул»-на второй, третий день — серожелтый и глинообразный. Кроме того у большинства заболевших появляется насморк, покраснения в горле, они испытывают боли при глотании. В острый период отсутствует аппетит , наблюдается упадок сил. Наиболее крупные вспышки заболевания возникают во время или в канун эпидемии гриппа, за что оно получило неофициальное название «кишечный грипп».
Кал и моча очень сходны по признакам с симптомами гепатита (светлый кал, тёмная моча, иногда с хлопьями крови). Обычно если в семье или в организованном коллективе есть инфицированные, то в течение 3-5 суток поочерёдно начинают заболевать остальные. Так как ротавирусы в большом количестве выделяется с калом, выявить их сравнительно легко методом ПЦР.
ПЦР (полимеразно-цепная реакция) — это метод, который позволяет найти в исследуемом клиническом материале небольшой участок генетической информации (ДНК) любого организма среди огромного количества других участков и многократно размножить его.
Биологический материал: кал.

Читать еще:  Сдать анализ на аллерген f281 карри приправа ige

Норовирусы 2 генотипа (Norovirus A)
Норовирусная инфекция – это желудочно-кишечная инфекция, вызванная норовирусом (Norovirus), в народе называют «желудочный грипп».
Норовирус (Norovirus) — это содержащий РНК вирус семейства Caliviridae.
Норовирус можно классифицировать на 5 геногрупп — G1, G2, G3, G4, G5, которые далее подразделяются на разные генотипы. Например, геногруппа -2 наиболее превалирующая человеческая геногруппа, которая содержит 19 генотипов. Генотипы — 1, 2, 4 вызывают поражение у человека, а геногруппа-3 инфицирует рогатый скот. Геногруппа-5 недавно была обнаружена у мышей. Эпидемиология. Норвавирусная инфекция поражает все возрастные группы, но чаще детей школьного возраста и взрослых. Восприимчивость к норвовирусам повсеместная. Сведения о появлении иммунитета после заболевания неопределенные. Резистентность к определённому штамму вируса может продолжаться от 4-6 месяцев до 2-3-х лет.
Источники инфекции: больной человек.
Пути передачи: фекально-оральный и контактный.
Факторы передачи: загрязненные вода и пища.
Клинические проявления.
Инкубационный период: от 24 до 51 часов, возможен менее продолжительный.
Заболевание вызванное норвовирусами характеризуется рвотой и диареей; часто сопровождается тошнотой, кишечной коликой, общим недомоганием, ознобом, головной болью. Лихорадка присутствует в половине случаев, как правило невысокая. Диарея умеренная по количеству 4-8 раз в сутки, без примеси крови. Клинические симптомы отмечаются в течение 24-60 часов, течение сомо-ограниченное. Более тяжелое течение отмечается у ослабленных и у больных со сниженным иммунитетом.
Для выявления вируса в стуле может быть выполнена ПЦР.
ПЦР (полимеразно-цепная реакция) — это метод, который позволяет найти в исследуемом клиническом материале небольшой участок генетической информации (ДНК)любого организма среди огромного количества других участков и многократно размножить его.
Биологический материал: кал.

Астровирусы (Astrovirus)
Астровирусная инфекция – это острая кишечная инфекция, вызванная астровирусами. Возбудитель – астровирус диаметром 28 нм. На сегодняшний день идентифицировано 8-серотипов астровирусов, из которых только один серотип (HAStV1) имеет существенное значение в развитии патологии человека.
Эпидемиология.
Астровирусной инфекцией приемущественно болеют дети до 7 лет, причем наиболее часто заболевание регистрируется у детей до года.
Сезонность при астровирусной инфекции нетипична.
Источник инфекции: больной человек.
Путь передачи: фекально-оральный и контактный.
Клиническая картина. Болезнь протекает как правило в ассоциации с энеробактериями и другими вирусами, в частности ротавирусами. Астровирус персистирует в организме 3-9 дней. Поражает эпителий кишечника и Пейеревы бляшки. При этом развивается энтерит, сопровождающийся поносом и обезвоживанием организма, снижением аппетита и симптомами интоксикации.
Исследования последних лет свидетельствуют, что одним из наиболее перспективных методов диагностики астровирусной инфекции является ПЦР.
ПЦР (полимеразно- цепная реакция) — это метод, который позволяет найти в исследуемом клиническом материале небольшой участок генетической информации (ДНК) любого организма среди огромного количества других участков и многократно размножить его.

Показания к ПЦР-диагностике:
-боли в животе
-жидкий стул
-урчание (слышное на расстоянии)
-вздутие живота
-боли вокруг пупка (усиливающиеся при дефекации)
-сочетание диареи с катаром верхних дыхательных путей.

HCV, РНК [реал-тайм ПЦР]

Исследование для выявления возбудителя гепатита C (HCV), в ходе которого с помощью метода полимеразной цепной реакции в реальном времени (РТ-ПЦР) определяется наличие генетического материала (РНК) вируса в крови.

Синонимы русские

Вирус гепатита С (ВГС), качественное определение РНК.

Синонимы английские

Hepatitis С Virus, RNA, Blood, HCV RNA, Real-Time PCR, Qualitative.

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией в режиме реального времени.

Читать еще:  Сдать анализ на adenovirus иммунофлюоресценция

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Как правильно подготовиться к исследованию?

Не курить в течение 30 минут до сдачи крови.

Общая информация об исследовании

Вирус гепатита С (HCV) – РНК-содержащий вирус из семейства Flaviviridae, который поражает печень. Он способен размножаться в клетках крови (нейтрофилах, моноцитах и макрофагах, В-лимфоцитах) и вызывать криоглобулинемию, болезнь Шегрена и В-клеточные лимфопролиферативные заболевания. HCV благодаря высокой мутационной активности может избегать воздействия защитных механизмов иммунной системы. Существует 6 генотипов и множество субтипов вируса, которые имеют разные значения для прогноза развития заболевания и эффективности противовирусной терапии.

Основной путь передачи инфекции – через кровь (препараты для переливания элементов крови и плазмы, донорские органы, нестерильные шприцы, иглы, инструменты для татуирования, пирсинга). Вероятно заражение при половом контакте и ребенка от матери во время родов, но это случается нечасто.

Острый вирусный гепатит, как правило, характеризуется бессимптомным течением и остается невыявленным в большинстве случаев. Только у 15 % инфицированных заболевание протекает остро – с тошнотой, ломотой в теле, отсутствием аппетита и потерей веса (редко сопровождается желтухой). У 60-85 % инфицированных развивается хроническая инфекция, что в 15 раз превышает частоту хронизации при гепатите В. Хронический вирусный гепатит С протекает с повышением печеночных ферментов и скудным проявлением симптомов. У 20-30 % больных заболевание приводит к циррозу печени, увеличивая риск развития печеночной недостаточности и гепатоцеллюлярной карциномы.

Выявление РНК HCV свидетельствует о размножении вируса в организме и помогает диагностировать заболевание. Генетический материал вируса можно обнаружить методом ПЦР через 10-12 дней после инфицирования – в этот период специфические антитела, которые образуются через несколько месяцев после заражения, отсутствуют и биохимические показатели функции печени находятся в пределах референсных значений. РНК вируса гепатита С с высокой специфичностью и чувствительностью определяют качественно или количественно. Благодаря качественному методу подтверждается факт инфицирования или гибели вируса. Это особенно важно в ранней диагностике вирусного гепатита у людей, подвергшихся риску заражения, а также при контроле за противовирусной терапией. При лечении альфа-интерфероном отсутствие РНК вируса через 24 недели после завершения терапии служит критерием ее эффективности.

Для чего используется исследование?

  • Для раннего выявления вирусного гепатита С.
  • Для дифференциальной диагностики гепатитов.
  • Для контроля за эффективностью противовирусного лечения.
  • Для мониторинга течения вирусного гепатита С.
  • Для проверки донорской крови.

Когда назначается исследование?

  • При сомнительных результатах серологического исследования.
  • При обследовании людей из группы риска по заражению вирусным гепатитом С.
  • Если ребенок родился от инфицированной матери.
  • При симптомах гепатита и повышенных биохимических показателях функции печени.
  • До лечения и в конце терапии, затем через 6 и 24 месяца наблюдения.

Что означают результаты?

Референсные значения: отрицательно.

Причины положительного результата

Причины отрицательного результата

  • Отсутствие вируса гепатита С в крови исследуемого.

Что может влиять на результат?

Причины ложноотрицательного результата:

  • минимальная вирусная нагрузка крови (менее 200 копий/мл);
  • наличие в образце ингибиторов – химических и белковых субстанций, влияющих на различные компоненты ПЦР;
  • присутствие в крови гепарина;
  • высокий уровень криоглобулинов в крови;
  • нарушение транспортировки и хранения материала.

Причины ложноположительного результата:

Важные замечания

  • Само по себе наличие РНК вируса гепатита С при отсутствии изменений других лабораторных показателей не позволяет диагностировать инфекцию со стопроцентной уверенностью. При этом необходимо повторное выявление РНК вируса методом ПЦР и комплексная оценка всех исследований. При хроническом гепатите С концентрация вирусного РНК меняется волнообразно – положительные и отрицательные результаты могут чередоваться, что требует проведения биопсии печени для уточнения диагноза и тактики лечения.
  • Прямой зависимости между активностью размножения вируса и изменением биохимических показателей функции печени нет.

Также рекомендуется

Кто назначает исследование?

Литература

  • Возианова Ж.И. Инфекционные и паразитарные болезни: В 3х т. — К.: Здоровье, 2000 – Т.1.: 600-690.
  • Кишкун А.А. Иммунологические и серологические исследования в клинической практике. — М.:ООО МИА, 2006 – 471-476 с.
  • Harrison’s Principles of Internal Medicine. 16 th ed. NY: McGraw-Hill; 2005: 1822-1855.
  • Lerat H, Rumin S, Habersetzer F, and others. In vivo tropism of hepatitis C virus genomic sequences in hematopoietic cells: influence of viral load, viral genotype, and cell phenotype. Blood. 1998 May 15;91(10):3841-9.PMID:9573022.
  • Revie D, Salahuddin SZ. Human cell types important for hepatitis C virus replication in vivo and in vitro: old assertions and current evidence. Virol J. 2011 Jul 11;8:346. doi: 10.1186/1743-422X-8-346. PMID:21745397.
Подписка на новости

Оставьте ваш E-mail и получайте новости, а также эксклюзивные предложения от лаборатории KDLmed

голоса
Рейтинг статьи
Ссылка на основную публикацию
Adblock
detector